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我國作為農(nóng)業(yè)大國秸稈資源量豐富,但利用率較低造成了資源浪費(fèi)和環(huán)境污染,利用秸稈生產(chǎn)沼

氣是提高秸稈利用率和緩解環(huán)境污染的有效途徑之  。新型沼氣池沼氣發(fā)酵是在多種微生物共同作用下完成的,

溫度,濃度,接種物,CN3,pH值和攪  拌“以及物料成分配比等對(duì)厭氧發(fā)酵有重要影  響。氮素是影響新型沼氣池沼氣發(fā)酵重要的營養(yǎng)元素之一,秸稈的碳氮比極高,這意味著以秸稈為原料的新型沼氣池沼氣發(fā)  酵體系中氮素對(duì)于發(fā)酵過程的影響可能更大,優(yōu)化發(fā)酵條件有利于微生物迅速繁殖,從而提高反應(yīng)器性能和新型沼氣池沼氣產(chǎn)量。

根據(jù)秸稈的分子式計(jì)算秸稈完全液化能夠提供厭氧發(fā)酵微生物所需的氮),但秸稈在實(shí)際發(fā)酵過程中很難全部被利用,且分解時(shí)間較長,微生物所需的氮含量不能在發(fā)酵各個(gè)階段滿足微生物的需求,尤其是在發(fā)酵初始階段,影響了新型沼氣池沼氣工程的發(fā)酵效率和最終產(chǎn)量。余少杰等通過添加不同濃度的氯化銨來研究外加氮源對(duì)秸稈厭氧發(fā)酵的影響,研究結(jié)果0顯示適量濃度的氮添加可以促進(jìn)厭氧發(fā)酵體系中纖維素等物料的水解,而高濃度的氮素添加會(huì)抑制纖維素水解和甲烷生成。 Pia tek等通過模型分析發(fā)現(xiàn)氮含量是影響水解和甲烷生成過程動(dòng)力學(xué)的關(guān)鍵因素。 Wagner等研究了添加不同種類的氮源在厭氧發(fā)酵過程中對(duì)甲烷產(chǎn)量的影響,發(fā)現(xiàn)  氮源中碳含量會(huì)影響甲烷的產(chǎn)率,在適宜的濃度范  圍內(nèi)才能獲得較高的甲烷產(chǎn)量。雖然原料中碳素轉(zhuǎn)  化為CH4和CO2是碳素間的循環(huán),但在厭氧發(fā)酵  中,微生物是將秸稈中的碳素轉(zhuǎn)化為CH4的功能執(zhí)  行者。 Wagner等從多樣性指數(shù)上分析了不同氮  源對(duì)微生物多樣性的影響,但未對(duì)功能菌株的豐度

變化進(jìn)行闡述。 Alsouleman'14-15等研究發(fā)現(xiàn),高氨  氮脅迫下厭氧反應(yīng)體系發(fā)生適應(yīng)性變化,主導(dǎo)菌群  從擬桿菌轉(zhuǎn)變?yōu)樗缶?。隨著宏基因組測序技術(shù)的快  速發(fā)展,應(yīng)用宏基因組技術(shù)來研究樣本中直接參與  碳和氮循環(huán)的功能微生物類群的總量和多樣性是近年來環(huán)境微生物的研究熱點(diǎn)之一,但對(duì)添加氮素后微生物群落多樣性以及功能基因的變化以及如何影響發(fā)酵體系和甲烷產(chǎn)量的研究鮮有報(bào)道。因此,研究氮素添加對(duì)新型沼氣池沼氣發(fā)酵過程中微生物群落和關(guān)鍵功能基因的影響具有重要意義。

本研究解析玉米秸稈新型沼氣池沼氣發(fā)酵過程中添加氮素對(duì)料液中微生物多樣性的影響,探究產(chǎn)甲烷關(guān)鍵功能基因豐度的變化,通過計(jì)算纖維素等物料的降解情況并結(jié)合產(chǎn)氣量與產(chǎn)氣周期,從微生物和功能基因的角度揭示氮素添加與秸稈新型沼氣池沼氣產(chǎn)量之間的關(guān)系,解析發(fā)酵過程中不同階段細(xì)菌、古菌的多樣性與  功能特征,注釋功能菌株的豐度的變化,進(jìn)一步探究

新型沼氣池沼氣發(fā)酵中關(guān)鍵因子的作用,為提高玉米秸稈新型沼氣池沼氣發(fā)酵產(chǎn)氣效率提供數(shù)據(jù)支撐。

1材料與方法

1、1試驗(yàn)原料

試驗(yàn)用玉米秸稈取自黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)實(shí)驗(yàn)實(shí)習(xí)基地,在10月份收獲籽粒后,秸稈風(fēng)干粉碎備用,接種污泥源于本實(shí)驗(yàn)室運(yùn)行良好的厭氧發(fā)酵反應(yīng)器,主要性質(zhì)見表1,其中玉米風(fēng)干秸稈的纖維素、半纖維素和木質(zhì)素含量分別為30.52%,27.77%和10.99%。

1.2間歇式秸稈新型沼氣池沼氣發(fā)酵體系建立

試驗(yàn)裝置選用25L自制厭氧發(fā)酵反應(yīng)器,上設(shè)有出氣口和進(jìn)料口,下設(shè)有出料口。出氣口與15L集氣袋相連,用于收集氣體并測定體積(見圖1)。甲烷含量通過GA2000便攜式新型沼氣池沼氣分析儀( GeotechBiogas Check)測定。發(fā)酵體積為20L,接種污泥12L,總TS設(shè)定為8%,啟動(dòng)時(shí)秸稈一次性進(jìn)料,不足蒸餾水補(bǔ)齊。

根據(jù)前期單因素試驗(yàn)結(jié)果,選取添加有機(jī)氮尿素1gL作為處理,不加氮為對(duì)照,設(shè)置3個(gè)重復(fù),控制發(fā)酵溫度為35℃,反應(yīng)時(shí)間60d。隨著發(fā)酵的  進(jìn)行,每10d進(jìn)行1次投料,物料添加量為總秸稈添加的1/6

1.3試驗(yàn)方法

1.3.116 SrrNA測序

在前期連續(xù)進(jìn)料的新型沼氣池沼氣發(fā)酵試驗(yàn)中,對(duì)照和處

理分別在發(fā)酵的第1.10,40天和60天進(jìn)行取樣,每

個(gè)樣品平行取3次,混合均勻后加入緩沖液( Extrac

tion Buffer)-20℃保藏。利用改進(jìn)的氯化芐法提取  樣品總DNA。采用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,使

用 Nanodrop200e(Them)檢測DNA的純度和濃

度。將合格的樣品總DNA送至四川博貝特生物科

技有限公司進(jìn)行高通量測序。PCR擴(kuò)增引物對(duì)應(yīng)

區(qū)域:細(xì)菌16V4區(qū)引物515F(5′ GTGCCAGO

MGCCGCGGTAA3)和909R(5′ CCCCGYCAATTC  MTTTRAGT3)。古菌引物344F(5′ ACGGGGYG

CAGCAGGCGCGA3)和806R(5′ GGACTACH

VGGGTWTCTAAT-3)

1.3.2統(tǒng)計(jì)分析

研究采用 oniginpro2017軟件對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理和分析。

1.3.3宏基因組學(xué)分析

在第一次產(chǎn)氣高峰第10天進(jìn)行取樣,處理與對(duì)照樣品平行取3次,混合均勻后加入緩沖液( Extraction Buffer),將樣品送至上海派森諾公司進(jìn)行DNA提取和宏基因組測序。

1.3.3.1物種注釋

將每個(gè)樣本的 Scaffolds/ Scanties序列與NCBlNT數(shù)據(jù)庫中的細(xì)菌、古菌、真菌和病毒序列進(jìn)行  BLASTN相似性比對(duì)(E值設(shè)定為<0.001)。由于每一條目標(biāo)序列可能匹配多條參考序列,而這些匹配的參考序列又分屬不同的分類單元,為使分析嚴(yán)謹(jǐn)可靠,同時(shí)又不丟失生物學(xué)意義,我們?cè)?MEGAN軟件中采取“最低共同祖先( Lowest Common Ancesor,LCA)”算法),將參考序列分化為不同物種分枝前的最后一級(jí)共同分類,作為目標(biāo)序列的物種分類注釋信息。結(jié)合 Scaffolds/ Scaftigs序列在各樣本中的豐度數(shù)據(jù),獲得各樣本在所需分類等級(jí)上的相對(duì)豐度分布表

1.3.3.2功能注釋

基因的功能注釋是將非冗余蛋白序列集同常用的蛋白數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì),從而對(duì)各樣本中的基因功能進(jìn)行注釋分析。KEGG注釋是指通過將蛋白序列和KEGG代謝通路數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì),對(duì)宏基因組預(yù)測得到的基因根據(jù)代謝通路進(jìn)行注釋和分類。我們將上述非冗余蛋白序列集上傳至KAS( KEGG AutomaticAnnotation Server)進(jìn)行功能注釋,并對(duì)返回的  g  注釋結(jié)果進(jìn)行匯總統(tǒng)計(jì),獲取各等級(jí)的注釋結(jié)果及

對(duì)應(yīng)的豐度信息。

2結(jié)果與分析

2.1添加氮素對(duì)間歇式秸桿新型沼氣池沼氣發(fā)酵產(chǎn)氣量的影響

在發(fā)酵的前28d,處理的日產(chǎn)氣量穩(wěn)定且高于對(duì)照(見圖2),在第10天達(dá)到第1個(gè)產(chǎn)氣高峰,為17750mLd-。處理和對(duì)照均在第25天達(dá)到產(chǎn)氣高峰,分別為15077mLd-和11707mL·d-。從第28天到第41天,對(duì)照恢復(fù)其產(chǎn)氣潛力,日產(chǎn)氣量高于處理,發(fā)揮產(chǎn)氣優(yōu)勢(shì)。發(fā)酵前30d進(jìn)料對(duì)產(chǎn)氣量的變化并不明顯,從第40天開始,處理和對(duì)照在產(chǎn)氣量上無顯著性差異,產(chǎn)氣趨勢(shì)相似。產(chǎn)氣量在每次進(jìn)料后均上升,之后開始下降,到下一次進(jìn)料產(chǎn)氣量又出現(xiàn)了顯著提升。測定發(fā)酵結(jié)束后纖維素和半纖維素降解率,處理達(dá)到33%和44%,顯著高于對(duì)照的6%和28%。

日產(chǎn)甲烷量變化趨勢(shì)與日產(chǎn)氣量的變化趨勢(shì)相似,筆者對(duì)發(fā)酵進(jìn)行不同天數(shù)后的累積甲烷產(chǎn)量進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析(見圖3),發(fā)酵前10d,20d,30d處理的甲烷累積產(chǎn)量分別是64943mL,137048mL,199459mL,顯著高于對(duì)照的14110mL,50343mL,123720mL。發(fā)酵前40d,處理的甲烷累積產(chǎn)量仍高于對(duì)照。發(fā)酵結(jié)束后,處理的甲烷總產(chǎn)量為308200mL,仍然高于對(duì)照的284728mL。處理在第10天達(dá)到第1個(gè)產(chǎn)甲烷高峰,為10880mL·d-1。對(duì)照在第20天達(dá)到一個(gè)峰值,為6103mL·d-1。處理和對(duì)照均在第23天達(dá)到日產(chǎn)甲烷產(chǎn)量的最高峰,分別為1388mL·d-和8164mL·d。從第26天到第41天,對(duì)照日產(chǎn)甲烷量高于處理。從第41天到發(fā)酵結(jié)束,處理和對(duì)照的甲烷產(chǎn)量無顯著差異。

發(fā)酵料液中提取的7個(gè)樣品總DNA條帶清晰,雜質(zhì)較少,無嚴(yán)重拖尾現(xiàn)象。 Nanodrop檢測出的DNA濃度在197.8~380.9ng·L之間,OD260/280在1.90~2.07之間,均符合送樣要求(濃度>10ng·L-;OD260/280在1.8-2.2之間)。對(duì)7個(gè)樣品中的細(xì)菌和古菌的16 SrRNA V4區(qū)序列進(jìn)行高通量測序。對(duì)比 Shannon指數(shù)可以看出(見表2),古菌的 Shannon指數(shù)均低于細(xì)菌,說明細(xì)菌的微生物多樣性要高于古菌的多樣性。比較處理和對(duì)照中的細(xì)菌 Alpha多樣性指數(shù),發(fā)酵第10天處理高于對(duì)照,隨著發(fā)酵的進(jìn)行,對(duì)照 Shannon指數(shù)增加,說明其多樣性有所增加,而處理的 Shannon指數(shù)和simpson指數(shù)均呈下降趨勢(shì),微生物多樣性下降。從古菌的 Alpha多樣性指數(shù)變化規(guī)律可以看出,處理中古菌多樣性的變化規(guī)律同處理中細(xì)菌變化一致。

2.2.2發(fā)酵料液中細(xì)菌和古菌群落組成分析  將細(xì)菌的各菌群豐度占比1%以上的25類菌  屬作圖(見圖4),從屬的分類水平進(jìn)行分析,發(fā)酵原  料中 Clostridium占比最高。對(duì)照中,普氏菌屬(Pre  wdla)、擬桿菌屬( Bacteroides)、瘤胃球菌屬(Rumi  m)和 Sphaerochaeta占比較高。處理中Ramnofilibacter,螺旋體屬( Treponema)和 Sphaerocho占比較高。比較發(fā)酵各時(shí)期對(duì)照和處理均表現(xiàn)出不同的細(xì)菌菌群組成,二者優(yōu)勢(shì)菌群各不相同,菌群多樣性存在差異。比較對(duì)照和處理發(fā)現(xiàn), Sphaerochaea菌屬在發(fā)酵的各時(shí)期均存在。

古菌的各菌群豐度在屬的分類水平上分析(見圖5),在整個(gè)發(fā)酵過程中,甲烷鬃毛菌屬( Methano-ea)(36.7%~68.7%)一直占據(jù)最高比例。對(duì)照中占比較高的菌群包括 Methanosaeta(45.8%5.1%), Methanoculleus(5.6%~16.2%)。處理中占比較高的菌群包括 Methanosaeta(36.7%~68.7%),

Methanoculleus(7.2%-14.2%)和甲烷螺旋菌屬M(fèi)ethanospirillum)(6.6%-85%)

在發(fā)酵第10天時(shí),對(duì)照中 Methanosaeta的豐度為57.1%,處理為36.7%,優(yōu)勢(shì)菌群 Methanosaeta的數(shù)量隨氮濃度的增加而減少。隨著發(fā)酵的進(jìn)行,處理中的 Methanosaeta豐度逐漸增加,但對(duì)照中卻

在中期開始減少。說明 Methanosaeta在氮素充足的環(huán)境中缺少競爭力,豐度下降。只有在環(huán)境中營養(yǎng)成分缺少的情況下 Methanosaeta的競爭力才開始顯現(xiàn),成為環(huán)境中的優(yōu)勢(shì)菌屬。 Methanoculleus的豐度也受氮素的影響,其豐度隨著氮濃度的升高而增加,Methanoculleus能在氮素充足的環(huán)境中快速成為優(yōu)勢(shì)菌屬,隨著發(fā)酵的持續(xù)和氮素的消耗,對(duì)照中Methanoculleus的豐度要高于處理。說明 Methaoculeus可以充分利用秸稈分解后的營養(yǎng)物質(zhì)成為環(huán)境中優(yōu)勢(shì)菌屬,在環(huán)境中有較強(qiáng)的競爭力和適應(yīng)能力。在發(fā)酵初期,氮素處理產(chǎn)氣顯著高于對(duì)照,可以看出在玉米秸稈厭氧發(fā)酵過程中, Methanoculleus對(duì)產(chǎn)氣的貢獻(xiàn)更大。隨著發(fā)酵的進(jìn)行,對(duì)照產(chǎn)氣量持續(xù)提升,較處理產(chǎn)氣率高,其中的甲烷桿菌屬( Methanobacterium)豐度逐漸提升,對(duì)產(chǎn)氣提升做出了較大貢獻(xiàn)。

2.3玉米秸稈新型沼氣池沼氣發(fā)酵體系宏基因組學(xué)研究  2.3.1物種豐度差異分析

前期16 SrRNA gene測序分析已經(jīng)證明在發(fā)酵  10d處理和對(duì)照在豐度上存在差異,利用宏基因組  數(shù)據(jù)可以進(jìn)一步分析每個(gè)樣本在各分類學(xué)水平的組  成豐度分布,逐一比較每個(gè)分類單元在兩個(gè)樣本之間的豐度差異,并通過統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)評(píng)價(jià)差異是否顯著。  處理與對(duì)照在門水平上有27個(gè)門具有顯著差異,屬  水平上有475個(gè)屬具有顯著差異,在種水平上有777個(gè)種具有顯著差異(見表3)。物種豐度的變化直接影響新型沼氣池沼氣發(fā)酵體系群落的功能性,尤其是功能

菌種豐度的顯著變化,通過以上數(shù)據(jù)可知,氮素添加  能夠顯著影響發(fā)酵體系中微生物的豐度。

2.3.2功能基因差異分析

在功能基因水平上,我們分析了能量代謝中各功能基因的豐度(見圖6),發(fā)現(xiàn)氮素處理中甲烷代謝( methane metabolism)的豐度高于處理,而氧化磷酸化等有關(guān)能量代謝的基因的豐度變化不明顯。甲烷代謝基因是產(chǎn)甲烷的關(guān)鍵基因,氮素添加提升了甲烷代謝基因的豐度。

討論

Wagner"等研究了多種氮源添加對(duì)產(chǎn)氣高峰期的影響,與本研究的氮素添加后產(chǎn)氣高峰提前且一段時(shí)間產(chǎn)氣量顯著提升的研究結(jié)果一致,但沒有對(duì)多周期發(fā)酵進(jìn)行測定。我們?cè)谘芯康靥砑拥陌脒B續(xù)發(fā)酵結(jié)果顯示,處理在中后期產(chǎn)氣能力低于對(duì)照。氮素添加雖然促進(jìn)了纖維素的水解,為古菌的代謝提供了營養(yǎng)底物。但隨發(fā)酵進(jìn)行,處理中其它微生物所需的元素和營養(yǎng)底物被大量消耗,后期雖然氮素含量和對(duì)照持平,但根據(jù)元素守恒定律,其它必需元素含量會(huì)低于對(duì)照。而對(duì)照初期由于氮素含量和其他營養(yǎng)物質(zhì)含量低,細(xì)菌代謝和纖維素水解受到限制,隨著發(fā)酵的進(jìn)行,纖維素水解產(chǎn)物等營養(yǎng)物質(zhì)含量增加,細(xì)菌和古菌多樣性逐漸提高,產(chǎn)氣潛力開始顯現(xiàn)。但整個(gè)發(fā)酵過程中處理的纖維素等物料的水解率顯著高于對(duì)照,提供了更多的營養(yǎng)物質(zhì),處理的總甲烷產(chǎn)量仍高于對(duì)照。

在發(fā)酵起始階段 Clostridium豐度占比較高,這與 Weimer1)等發(fā)現(xiàn) Clostridium能夠?qū)⒗w維素和半纖維素等大分子水解成葡萄糖的結(jié)果一致。甲烷八

更球菌屬( Methanosarcina)等產(chǎn)甲烷古菌的豐度提  升可能和產(chǎn)酸菌群一樣受氮素含量和底物濃度影  響。產(chǎn)氣高峰期 Methanosarcina豐度增加,對(duì)產(chǎn)甲  具有較大貢獻(xiàn),這與 Bharathi等的研究結(jié)論一  hmm在處理和對(duì)照中豐度一直占據(jù)優(yōu)  致。  ,Cam2)等發(fā)現(xiàn) Methanosaeta有較強(qiáng)的產(chǎn)甲烷能  力結(jié)論與本研究結(jié)果相似。發(fā)酵體系中還注釋到  Sphaerochaeta,AbtB(21等曾在白蟻的腸道中分離出  該均屬。 Ritalaht(2等曾在紅杉河底層沉積物中分  離出 Sphaerochaeta globosa,發(fā)現(xiàn)其能利用多種底物  進(jìn)行發(fā)酵產(chǎn)甲酸鹽和乙酸鹽。但在新型沼氣池沼氣發(fā)酵體系  中,鮮有關(guān)于 zerochaeta的報(bào)道,其在玉米秸稈降  解產(chǎn)甲烷環(huán)境中可能具有重要作用。  張彩杰2等在研究了C/N對(duì)細(xì)菌群落的影響時(shí)發(fā)現(xiàn)碳氮比降低,細(xì)菌多樣性提升,優(yōu)勢(shì)菌群豐度增高,這與本研究發(fā)現(xiàn)細(xì)菌的變化規(guī)律相同。本研究還分析了在產(chǎn)甲烷階段具有重要作用的古菌群落多樣性,發(fā)現(xiàn)古菌的群落多樣性變化和細(xì)菌相似對(duì)于食氫產(chǎn)甲烷菌和食乙酸產(chǎn)甲烷菌來說,豐富的

養(yǎng)底物可以被利用進(jìn)行代謝,此時(shí),產(chǎn)甲烷功能基因的豐度要比環(huán)境中微生物的多樣性更為重要Lin(21等發(fā)現(xiàn)功能基因的多樣性提升不利于代謝途徑的有序性,并且可能帶來更多的功能冗余,在探究有關(guān)能量代謝的基因豐度變化時(shí)發(fā)現(xiàn),甲烷代謝相關(guān)基因豐度的增加和新型沼氣池沼氣產(chǎn)量呈正相關(guān),與Qiang23等研究溫度對(duì)新型沼氣池沼氣發(fā)酵體系影響的結(jié)果致。雖然本研究沒有探究功能基因的多樣性與產(chǎn)氣量的關(guān)系,但處理中的甲烷代謝功能基因表達(dá)顯得更為集中。這說明氮素的添加和溫度一樣對(duì)甲烷代謝的功能基因具有調(diào)節(jié)作用。

本研究發(fā)現(xiàn)處理中古菌的多樣性雖然提升了,  但甲烷代謝的功能基因的豐度并沒有降低,說明微  生物多樣性提升和功能基因的集中表達(dá)不存在矛  盾。 Shade20等認(rèn)為微生物的多樣性只是環(huán)境微生  物中一個(gè)單純的指標(biāo),我們同樣認(rèn)為多樣性的高低  不能直接說明一定的問題,復(fù)雜的代謝過程需要多  種功能微生物共同參與,又或者環(huán)境中微生物多樣性低,而重要的功能微生物豐度又占據(jù)絕對(duì)優(yōu)勢(shì),或許這正是我們想要的,但自然環(huán)境往往不是這樣的,這同樣需要在具體的環(huán)境中分析。

4結(jié)論

(1)以玉米秸稈為原料的厭氧新型沼氣池沼氣發(fā)酵過程

中,利用16 SrRNA gene和宏基因組測序技術(shù)分析發(fā)現(xiàn),氮素添加能夠提升厭氧發(fā)酵過程中細(xì)菌的多樣性和豐度,細(xì)菌多樣性的變化特別是具備纖維素降解功能菌株豐度的提升能夠加速纖維素、半纖維素等物質(zhì)的水解和代謝過程。氮素添加和纖維素等物質(zhì)的加速分解有效的提升了反應(yīng)器內(nèi)古菌代謝所需  的營養(yǎng)底物,提升了古菌的多樣性和豐度,促進(jìn)了產(chǎn)甲烷古菌的代謝和甲烷代謝基因豐度的提升。  (2)氮素添加通過提升微生物的豐度以及產(chǎn)甲  烷功能基因的豐度,縮短了達(dá)到產(chǎn)氣高峰所需的周  期,并在一段時(shí)間內(nèi)維持穩(wěn)定的產(chǎn)氣量和甲烷含量,  最終在整個(gè)發(fā)酵周期內(nèi)顯著提升新型沼氣池沼氣產(chǎn)氣量和TS甲烷產(chǎn)率。

摘自《中國沼氣》第5期 趙一全 馬茹霞 李家威 晏磊 羅濤 梅自力 王偉東